信息科学技术学院于2019年1月由原电子信息学院和原计算机科学与技术学院合并组建，现有电子信息工程、通信工程、电子科学与技术、集成电路设计与集成系统、电子信息科学与技术、生物医学工程、计算机科学与技术、软件工程、网络工程、物联网工程、数据科学与大数据技术等11个本科专业，其中电子信息工程、通信工程、计算机科学与技术等3个专业为国家级一流本科专业建设点、江苏省高校特色专业、省高校品牌建设工程一期项目立项专业和中国工程教育认证专业，电子信息类专业为江苏省高校重点专业类。同时，通信工程、电子科学与技术、计算机科学与技术、软件工程等专业为江苏省卓越工程教育培养计划专业。

学院现有信息与通信工程、电子科学与技术、计算机科学与技术等一级学科。信息与通信工程一级学科具有博士和硕士学位授予权，是江苏省“十二五”、“十三五”重点学科，在全国第四轮学科评估中成绩为C+，上榜软科中国最好学科；ESI工程学排名进入全球前1%，学院贡献度超过50%。具有电子信息（计算机技术、电子与通信工程、集成电路工程）专业硕士学位授予权。建有江苏省专用集成电路设计重点实验室和信息与通信工程学科博士后流动站。学院设有信息工程系、通信工程系、电子工程系、计算机科学与技术系、软件工程系、网络工程系等6个系和学院实验中心，其中南通大学EDA实验中心、南通大学信息与通信工程实验中心、南通大学计算机应用技术实验中心为江苏省高校实验教学示范中心。

学院现有教职员工211人，其中专任教师170人，教授32人，副教授73人，博士106人，专任教师的高职比为61.77%，具有博士学位的人数占专任教师总数的62.36%。学院现有全日制本科生3465人，硕士生405人，博士生36人。

学院主持建设通科微电子学院和阿里云大数据学院两个政校企共建的产业学院，与清华大学合作共建南通先进通信技术研究院。建有南通市电子信息技术公共服务平台、南通市虚拟现实技术公共技术服务平台、南通市高性能计算重点实验室，南通市射频产品设计与检测公共服务平台等。学院先后与通富微电子股份有限公司、中天科技集团、韩华新能源（启东）有限公司、上海南麟电子股份有限公司等50多家企业深入开展产学研合作，提供技术指导、专业咨询和科研合作，获得企业的好评。